Στις 8 Φεβρουαρίου 2005, ο Κάρολος Παπούλιας εξελέγη με πρωτόγνωρη για τα ελληνικά πολιτικά θέσμια πλειοψηφία από τη Βουλή των Ελλήνων ο έκτος Πρόεδρος της μεταπολιτευτικής Ελληνικής Δημοκρατίας.
Στις 8 Φεβρουαρίου 2005, ο Κάρολος Παπούλιας εξελέγη με πρωτόγνωρη για τα ελληνικά πολιτικά θέσμια πλειοψηφία από τη Βουλή των Ελλήνων ο έκτος Πρόεδρος της μεταπολιτευτικής Ελληνικής Δημοκρατίας.
Τα δύο μεγαλύτερα κόμματα στήριξαν την υποψηφιότητα Παπούλια, η οποία είχε προταθεί από τον πρωθυπουργό, Κώστα Καραμανλή, ενώ «παρόντες» δήλωσαν μόνο οι 17 παριστάμενοι βουλευτές του ΚΚΕ και του Συνασπισμού. Έτσι, ο Κάρολος Παπούλιας εξελέγη με 279 ψήφους.
Στις 12 Μαρτίου, ο 76χρονος πρώην υπουργός Εξωτερικών ανέλαβε επισήμως τα καθήκοντά του και από την πρώτη στιγμή φάνηκε ότι θα συνέχιζε την πολιτική του προκατόχου του, Κωστή Στεφανόπουλου, με λεκτικές και όχι μόνο παρεμβάσεις σε αρκετά σημαντικά ζητήματα του τόπου.
Αποκορύφωμα ήταν η αποχώρηση του Προέδρου της Δημοκρατίας από την Αλβανία την 1η Νοεμβρίου εξαιτίας της προκλητικής συμπεριφοράς ακραίων εθνικιστικών στοιχείων. Συγκεκριμένα, ο Κάρολος Παπούλιας επρόκειτο να συναντηθεί με τον Αλβανό ομόλογό του Αλφρεντ Μοϊσίου στους Αγίους Σαράντα. Την ίδια ώρα, διαδηλωτές της οργάνωσης «Τσαμερία» είχαν συγκεντρωθεί έξω από το ξενοδοχείο όπου θα γινόταν η συνάντηση και προκάλεσαν ιδιαίτερα αρνητικό κλίμα, εγείροντας ανύπαρκτα θέματα Τσάμηδων στην Ελλάδα.
Ο Κάρολος Παπούλιας παρέμεινε για περισσότερο από δύο ώρες στο Γενικό Προξενείο της Ελλάδος στο Αργυρόκαστρο και στη συνέχεια με δική του πρωτοβουλία ματαίωσε την συνάντηση με τον Μοϊσίου επέστρεψε στην Ελλάδα.
Ο κ. Παπούλιας είχε κάνει και νωρίτερα παρεμβάσεις σε άλλα σημαντικά εθνικά θέματα. Αναφερόμενος στην ονομασία της ΠΓΔΜ, είχε δηλώσει χαρακτηριστικά ότι «η Μακεδονία ήταν πάντοτε ελληνική, παραμένει ελληνική και θα παραμείνει ελληνική. Και θα πρέπει αυτοί οι κύριοι να υιοθετήσουν άλλες συμπεριφορές».
Αυστηρό μήνυμα έχει απευθύνει αρκετές φορές και στην Τουρκία. Στη συνάντησή του με τον πρόεδρο της Αρμενίας Ρομπέρ Κοτσαριάν, έκανε λόγο για έναν «δύσκολο γείτονα» που έχουν οι δύο χώρες, ενώ με ευκαιρία την εθνική επέτειο της 28ης Οκτωβρίου διαμήνυσε στην Αγκυρα ότι «ευρωπαϊκή προοπτική και casus belli είναι έννοιες αταίριαστες».