Το μουσείο φιλοξενεί τα σημαντικότερα αρχαιολογικά ευρήματα από την ανατολική Κρήτη, όπως από το Παλαιόκαστρο, το νησί του Μόχλου, το νεκροταφείο του Αγίου Γεωργίου, το ανάκτορο της Ζάκρου, την ελληνιστική πόλη του Ζαρόκαμπου και από την πόλη Ίτανο.
Το μουσείο φιλοξενεί τα σημαντικότερα αρχαιολογικά ευρήματα από την ανατολική Κρήτη, όπως από το Παλαιόκαστρο, το νησί του Μόχλου, το νεκροταφείο του Αγίου Γεωργίου, το ανάκτορο της Ζάκρου, την ελληνιστική πόλη του Ζαρόκαμπου και από την πόλη Ίτανο.