Λογισμικό προσομοιώνει το μεταβολισμό βακτηρίου
Το πρώτο υπολογιστικό μοντέλο του μεταβολισμού ενός ζωντανού οργανισμού παρουσιάζεται την Παρασκευή στο περιοδικό Science. Το μοντέλο του βακτηρίου Thermatoga maritima προσομοιώνει τις λειτουργίες 478 πρωτεϊνών, των οποίων η δομή υπολογίστηκε σε επίπεδο ατόμου.
36
Το πρώτο υπολογιστικό μοντέλο του μεταβολισμού ενός ζωντανού οργανισμού παρουσιάζεται την Παρασκευή στο περιοδικό Science.
Ερευνητική κοινοπραξία στις ΗΠΑ προσομοίωσε το κεντρικό μεταβολικό δίκτυο ενός βακτηρίου που ζει σε θερμά νερά, του Thermatoga maritima.
Το μοντέλο περιλαμβάνει 478 πρωτεΐνες, των οποίων οι δομές υπολογίστηκαν σε επίπεδο ατόμου. Περιλαμβάνει επίσης τις αλληλεπιδράσεις των πρωτεΐνών αυτών με 562 ουσίες του μεταβολισμού σε 562 ενδοκυτταρικές και 83 εξωκυτταρικές μεταβολικές αντιδράσεις.
«Δημιουργήσαμε τρισδιάστατα μοντέλα όλων των πρωτεΐνών στο κεντρικό μεταβολικό σύστημα» του μικροβίου, αναφέρει ο Ανταμ Γκότζικ του αμερικανιkού Ινστιτούτου Ιατρικής Έρευνας Burnham, μέλος της διατομεακής ερευνητικής ομάδας.
Το μοντέλο ατομικής κλίμακας προσομοιώνει τις μεταβολικές αντιδράσεις σε βιοχημικό και μοριακό επίπεδο και θα μπορούσε να εμβαθύνει σημαντικά τη μελέτη των ζωντανών οργανισμών.
Θα μπορούσε επίσης «να βοηθήσει στην αναγνώριση των θετικών και των ανεπιθύμητων αλληλεπιδράσεων ανάμεσα σε φάρμακα», ελπίζουν οι ερευνητές.
Newsroom ΑΛΤΕΡ ΕΓΚΟ
- Πιο ζόρικα δεν γίνεται για τον Χάου
- Το Ιράν ανακοίνωσε ότι υποδομές νερού και ενέργειας υπέστησαν σοβαρές ζημιές
- Πώς μπορεί να εξακριβωθεί εάν ένας πίνακας είναι αληθινός – Η αλλαγή στο νόμο για τα πλαστά έργα τέχνης
- Μπαρτσελόνα – Βαγιεκάνο 1-0: Στο +7 οι Καταλανοί με Αραούχο
- Δημοσκόπηση: 6 στους 10 Αμερικανούς αποδοκιμάζουν τον πόλεμο στο Ιράν
- Super Leauge 2: Με «τριάρα» πανηγύρισε ο Ηρακλής στη φιέστα ανόδου (3-1)
