Το μουσείο περιλαμβάνει τα ανασκαφικά ευρήματα από την Πέλλα και την ευρύτερη περιοχή. Ανάμεσά τους ξεχωρίζουν αυτά των ιδιωτικών κατοικιών, της αγοράς, των ιερών, των νεκροταφείων, αλλά και τα ψηφιδωτά δάπεδα, τα αρχιτεκτονικά μέλη και τα νομίσματα.