Το μουσείο περιλαμβάνει συλλογή ευρημάτων του γεωμετρικού οικισμού Ζαγοράς, συλλογή γλυπτών από την Αρχαϊκή μέχρι τη Ρωμαϊκή εποχή, συλλογή επιγραφών και συλλογή γλυπτών Πρωτοβυζαντινής και Βυζαντινής εποχής.