Τα ευρήματα του μουσείου προέρχονται από τις ανασκαφές στην πόλη και στα νεκροταφεία των αρχαίων Αβδήρων. Τα εκθέματα, τοιχογραφίες, γυάλινα αρωματοδοχεία, πήλινα ειδωλια κ.ά., χρονολογούνται από τον 7ο π.Χ. έως το 13ο μ.Χ.
αιώνα.