Λογισμικό διαβάζει την επιστημονική βιβλιογραφία για λογαριασμό ερευνητών

36

Λογισμικό που «διαβάζει» την επιστημονική βιβλιογραφία και προβλέπει τις λειτουργίες και τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ ανθρώπινων γονιδίων κατάφεραν να δημιουργήσουν Νορβηγοί επιστήμονες, σε μια προσπάθεια να επιταχύνουν την ιατρική έρευνα, αλλά και να… αποφύγουν την αγγαρεία.

Σύμφωνα με το New Scientist, το πρόγραμμα «σαρώνει» τους τίτλους και τις περιλήψεις επιστημονικών δημοσιεύσεων, και αναγνωρίζει τα ονόματα ανθρώπινων γονιδίων. Η λειτουργία του βασίζεται στην υπόθεση ότι, εάν δύο γονίδια αναφέρονται στην ίδια δημοσίευση, οι λειτουργίες τους πρέπει να σχετίζονται.

Ο δρ. Αϊνβιντ Χόβιγκ, δημιουργός του λογισμικού στο νοσοκομείο Radiumhospital της Νορβηγίας, το έχει ήδη χρησιμοποιήσει για να «διαβάσει» με την άνεσή του πάνω από δέκα εκατομμύρια από τις δημοσιεύσεις που είναι διαθέσιμες στη δημόσια βάση δεδομένων MEDLINE, όπου καταχωρίζονται οι περισσότερες γενετικές έρευνες. Το πρόγραμμα κατέφερε να βρει αναφορές για 13.712 από τα περίπου 26.000 ανθρώπινα γονίδια.

Τα δεδομένα που συλλέχτηκαν καταχωρίστηκαν στη νέα βάση δεδομένων PubGene, όπου οι ερευνητές μπορούν να δουν με ποια γονίδια είναι πιθανόν να αλληλεπιδρά το τμήμα DNA που ενδιαφέρονται να μελετήσουν, καθώς και τις βιολογικές λειτουργίες στις οποίες αυτό ίσως συμμετέχει.

Η PubGene προβλέπει ποια γονίδια είναι πιθανόν να αλληλεπιδρούν με ακρίβεια επτά φορές μεγαλύτερη από ό,τι στην περίπτωση που η επιλογή ήταν τυχαία. Ωστόσο, όταν το λογισμικό χρησιμοποιήθηκε για να αναλύσει δοκιμαστικά άλλες βάσεις γενετικών δεδομένων, κατάφερε να προσδιορίσει μόνο τις μισές από τις γνωστές αλληλεπιδράσεις. Εντόπισε όμως άγνωστους μέχρι τότε συσχετισμούς γονιδίων, οι οποίοι αργότερα αποδείχθηκαν ορθοί.

Παρ όλο που ο… εικονικός επιστήμονας δεν μπορεί σε καμία περίπτωση να απαλλάξει εντελώς τους ερευνητές από το καθήκον να παρακολουθούν τη διεθνή βιβλιογραφία, σίγουρα έχει τη δυνατότητα να απλοποιήσει σημαντικά τη μελέτη των αλληλεπιδράσεων μεταξύ των γονιδίων, με στόχο τη δημιουργία νέων φαρμάκων και την εξατομίκευση της ιατρικής θεραπείας.

Newsroom ΑΛΤΕΡ ΕΓΚΟ