Το βιοαέριο, που εκλύεται στις χωματερές από την αποσύνθεση των οργανικών υλικών, ελευθερώνεται στην ατμόσφαιρα και συμβάλλει με τα άλλα αέρια στο φαινόμενο του θερμοκηπίου και την αλλαγή του παγκόσμιου κλίματος. Επίσης, ευθύνεται και για τις αυταναφλέξεις των απορριμμάτων, για εκρήξεις ή ακόμη και  για κατάρρευση ολόκληρων περιοχών (π.χ. έκρηξη και κατάρρευση στη χωματερή της Κων/πολης με δεκάδες νεκρούς). Επίσης, οι σκουπιδότοποι αποτελούν αιτία για το περίπου 10% των πυρκαϊών στη χώρα μας. Μερικές από τις μεγαλύτερες πυρκαγιές των τελευταίων χρόνων έχουν ξεκινήσει από σκουπιδότοπους, όπως για παράδειγμα από τον σκουπιδότοπο της Αυλώνας ξεκίνησε πυρκαγιά που έκαψε μεγάλες δασικές εκτάσεις στην Αττική.