Ένας επιστήμονας παρασκευάζει στα εργαστήρια τον ιό «Χίμαιρα» και το αντίδοτό του, που ονομάζει «Βελεροφόντη». Όμως, τα φιαλίδια πέφτουν στα χέρια του πρώην πράκτορα Sean Ambrose, ο οποίος ζητά λύτρα για να μην αφήσει ελεύθερο το θανατηφόρο μικρόβιο. Ο Ethan Hunt αναλαμβάνει να βρει και να καταστρέψει τα επικίνδυνα σκευάσματα.