Κινέζοι γενετιστές πρωτοστατούν στη μάχη κατά της τοξικής E.coli

Ακούγεται ίσως απίθανο, δεδομένου ότι το Πεκίνο είχε προσπαθήσει να συγκαλύψει την εμφάνιση του SARS το 2003. Κι όμως, ήταν η Κίνα που αναγνώρισε πρώτη τον ένοχο σε μια επιδημία που αναστατώνει την Ευρώπη εδώ και τρεις εβδομάδες.

Το γονιδίωμα της νέας Escherichia coli προσδιορίστηκε σε χρόνο-ρεκόρ από το Ινστιτούτο Γενωμικής του Πεκίνου (BGI), το μεγαλύτερο κέντρο του κόσμου όσον αφορά τον προσδιορισμό γενετικών αλληλουχιών.

• Φάρμα στη Γερμανία «δείχνουν» οι Αρχές ως εστία της επιδημίας Ε.coli
• Σταθεροποιείται η επιδημία E.coli, σε γερμανικά λαχανικά στρέφονται τώρα οι υποψίες
  

Το Ινστιτούτο έλαβε δείγματα από τη Γερμανία και χρειάστηκε μόλις τρεις ημέρες για να ολοκληρώσει την αλληλουχία του νέου βακτηρίου. Την περασμένη Πέμπτη ανακοίνωσε ότι πρόκειται για «νέο στέλεχος του βακτηρίου με υψηλή μολυσματικότητα και τοξικότητα».

Οι Κινέζοι ερευνητές αναγνώρισαν επίσης τα γονίδια ανθεκτικότητας που κάνουν τη νέα E.coli απρόσβλητη από τουλάχιστον τρεις κατηγορίες αντιβιοτικών -κάτι που εξηγεί τις σοβαρές επιπτώσεις της επιδημίας, από η οποία έχει πλήξει πάνω από 2.000 ανθρώπους και έχει σκοτώσει 22. Επίκεντρο της επιδημίας είναι η περιοχή γύρω από το Αμβούργο, και τα
κρούσματα που έχουν αναφερθεί σε ακόμα 12 χώρες σχετίζονται με ταξίδια
στη Γερμανία.

Συστάσεις με τον αντίπαλο

Τα αντιβιοτικά στα οποία έχει ανθεκτικότητα το νέο κολοβακτηρίδιο είναι φάρμακα πρώτης γραμμής που χρησιμοποιούνται σε γαστρεντερίτιδες και προληπτικά πριν από χειρουργικές επεμβάσεις.

Άλλα γονίδια που αναγνωρίστηκαν στο DNA του βακτηρίου ευθύνονται για τις τοξίνες Σίγκα που προκαλούν επιπλοκές όπως το σπάνιο και δυνητικά θανατηφόρο αιμολυτικό ουραιμικό σύνδρομο.

Παρά την πρόοδο, όμως, η έρευνα για τον χαρακτηρισμό του βακτηρίου συνεχίζεται στο κύριο ερευνητικό σκέλος του BGI, το οποίο βρίσκεται στην πλούσια πόλη του Σενζέν, λίγο βόρεια του Χονγκ Κονγκ.

«Προχωρήσαμε σε περαιτέρω ανάλυση και βλέπουμε κι άλλα γονίδια ανθεκτικότητας και τοξικότητας. Η εργασία μας συνεχίζεται» δήλωσε στο Reuters o Τσιν Τζουντσίε, μέλος της ομάδας που προσδιόρισε τη γενετική αλληλουχία του βακτηρίου.

Με το πορτρέτο του αντίπαλο να ολοκληρώνεται σταδιακά, οι Κινέζοι ερευνητές αναπτύσσουν τώρα ένα διαγνωστικό τεστ που θα ταυτοποιεί τα κρούσματα ταχύτερα από ό,τι οι σημερινές εργαστηριακές μέθοδοι.

Υβρίδιο

Όπως διαπίστωσαν τόσο οι Κινέζοι ερευνητές όσο και συνάδελφοί τους στην Ευρώπη, το νέο στέλεχος της E.coli φαίνεται να έχει προκύψει από ανασυνδυασμό άλλων στελεχών του βακτηρίου.

Στη φύση υπάρχουν αναρίθμητα στελέχη του συγκεκριμένου κολοβακτηριδίου -τα περισσότερα είναι αβλαβή ή και ωφέλιμα και ζουν στο πεπτικό σύστημα του ανθρώπου και άλλων ζώων.

«Αυτό το βακτήριο είναι παράξενο πλάσμα. Πολλά από τα γονίδιά του φαίνεται να προέρχονται από διαφορετικά στελέχη E.coli, κάτι που δίνει σε αυτό το στέλεχος την ικανότητα να προκαλεί αιμολυτικό ουραιμικό σύνδρομο και/ή αιμορραγική διάρροια» ανέφερε ο Τσιν Τζουντσίε, αντιπρόεδρος του κέντρου Μικροβιολογίας του Ινστιτούτου.

Το κέντρο χρηματοδοτείται από την πλούσια πόλη του Σενζέν και προσφέρει υπηρεσίες προσδιορισμού αλληλουχίας σε άλλα δημόσια και ιδιωτικά ερευνητικά κέντρα σε όλο τον κόσμο.

Το κέντρο διαθέτει 180 μηχανήματα προσδιορισμού αλληλουχίας (sequencer) και 4.000 ερευνητές. «Μόνο για τον προσδιορισμό αλληλουχιών έχουμε 300 ερευνητές» υπερηφανεύτηκε στο Reuters ο Γιανγκ Μπιτσένγκ, διευθυντής Μάρκετινγκ του Ινστιτούτου.

Τα τελευταία χρόνια, το BGI δίνει έμφαση και στις τεχνολογίες κλωνοποίησης ζώων και γενετικής τροποποίησης καλλιεργειών.

Οι ερευνητές του ινστιτούτου, πολλοί από τους οποίους έχουν εκπαιδευτεί σε μεγάλα πανεπιστήμια της Ευρώπης και των ΗΠΑ, έχουν μάλιστα αναπτύξει δικές τους τεχνικές κλωνοποίησης, χάρη στις οποίες δημιουργούν έως και 200 κλωνοποιημένα έμβρυα χοίρου την ημέρα.

Πρόσφατα μάλιστα το ινστιτούτο δημιούργησε θυγατρική εταιρεία για την εμπορική αξιοποίηση του κλωνοποιημένου κρέατος.

Newsroom ΑΛΤΕΡ ΕΓΚΟ