Λογισμικό προσομοιώνει το μεταβολισμό βακτηρίου
Το πρώτο υπολογιστικό μοντέλο του μεταβολισμού ενός ζωντανού οργανισμού παρουσιάζεται την Παρασκευή στο περιοδικό Science. Το μοντέλο του βακτηρίου Thermatoga maritima προσομοιώνει τις λειτουργίες 478 πρωτεϊνών, των οποίων η δομή υπολογίστηκε σε επίπεδο ατόμου.
36
Το πρώτο υπολογιστικό μοντέλο του μεταβολισμού ενός ζωντανού οργανισμού παρουσιάζεται την Παρασκευή στο περιοδικό Science.
Ερευνητική κοινοπραξία στις ΗΠΑ προσομοίωσε το κεντρικό μεταβολικό δίκτυο ενός βακτηρίου που ζει σε θερμά νερά, του Thermatoga maritima.
Το μοντέλο περιλαμβάνει 478 πρωτεΐνες, των οποίων οι δομές υπολογίστηκαν σε επίπεδο ατόμου. Περιλαμβάνει επίσης τις αλληλεπιδράσεις των πρωτεΐνών αυτών με 562 ουσίες του μεταβολισμού σε 562 ενδοκυτταρικές και 83 εξωκυτταρικές μεταβολικές αντιδράσεις.
«Δημιουργήσαμε τρισδιάστατα μοντέλα όλων των πρωτεΐνών στο κεντρικό μεταβολικό σύστημα» του μικροβίου, αναφέρει ο Ανταμ Γκότζικ του αμερικανιkού Ινστιτούτου Ιατρικής Έρευνας Burnham, μέλος της διατομεακής ερευνητικής ομάδας.
Το μοντέλο ατομικής κλίμακας προσομοιώνει τις μεταβολικές αντιδράσεις σε βιοχημικό και μοριακό επίπεδο και θα μπορούσε να εμβαθύνει σημαντικά τη μελέτη των ζωντανών οργανισμών.
Θα μπορούσε επίσης «να βοηθήσει στην αναγνώριση των θετικών και των ανεπιθύμητων αλληλεπιδράσεων ανάμεσα σε φάρμακα», ελπίζουν οι ερευνητές.
Newsroom ΑΛΤΕΡ ΕΓΚΟ
- Κεφαλονιά: Εμπλοκή και άλλων ατόμων στον θάνατο της 19χρονης εξετάζουν οι Αρχές – Προφυλακιστέοι οι τρεις κατηγορούμενοι
- Ο Σπανούλης, το τηλεφώνημα της Ντουμπάι και η αρνητική απάντηση
- Στενά Ορμούζ: Η αποκατάσταση της κυκλοφορίας των πλοίων ενδέχεται να διαρκέσει αρκετούς μήνες
- Ντέβιντ Ρικάρντο: Πώς εξηγεί η θεωρία του το συγκριτικό πλεονέκτημα σε έναν κόσμο εμπορικών συγκρούσεων
- Νάταλι Πόρτμαν: Έγκυος στο τρίτο της παιδί
- Οι αθλητικές μεταδόσεις (18/4): Πού θα δείτε τα ματς της Super League, τον τελικό του Copa del Rey και Premier League
